夏休みが終わり、魔法学園に新学期がやってきた！ 超絶イケメンの“氷の騎士様”ことフォルトとの仲は曖昧？なまま、アリスは得意の魔法石知識とケタ外れの魔力でうっかり凄い新アイテムを発明してしまったり、魔法実技試験に翻弄されたりと、相変わらずの日々。大好きな級友たちや、なぜか一方的に好かれている聖獣カーバンクルとともに奮闘するアリスだったが、今度は意地悪な令嬢・レベッカの行動が発端で、闇の力をめぐる怪しげな事件に巻き込まれるハメに！ しかも、なぜか続発する異常事態は、やがて王国全体を巻き込みかねない大騒動にまで発展してしまい……!?
